מגמת מחשבים הינה מגמה עצמאית וגם כזו המאפשרת להמשיך על גביה ללמוד במגמת העל – מדעי המחשב – הייטק. מדרשית נעם אורט היא הבית ספר הממלכתי דתי הכי טוב בארץ במדעי המחשב. תלמידי המגמה נחושים להצליח בהכרת נבכי עולם המחשבים ולקדם את יכולותיהם בהווה ובעתיד בעולם הנמצא כיום כבסיס כל מערכת בכל תחום ומקום. התלמידים ניגשים לבגרות בהיקף של 5 יחידות לימוד.