ראשי ישיבות גבוהות והסדר, רבני ערים, דיינים ותלמידי חכמים גדולים רבים גידלה מדרשית נעם לאורך הדורות. מאז ומעולם היה בית המדרש ולימוד הגמרא, ההלכה והאמונה הלב הפועם של הישיבה.
מזה כעשור קיים בישיבה "בית המדרש למצוינות ותגבור" אשר במסגרתו:
- כיתת מצוינות – בהובלת ראש הכולל פועלת כיתת מצוינות המורכבת מתלמידים משכבות הגיל השונות המבקשים להעמיק בלימוד סוגיות שונות בש"ס בעיון רב יותר מהמתאפשר בכיתה הרגילה.
- סיוע ותגבור – אברכי הכולל מסייעים בלימוד אישי ובקבוצות קטנות לאלו המבקשים ללמוד בצורה איטית יותר ולתלמידים אשר החסירו ומבקשים להשלים את החומר הנלמד.
מוסיפים בקודש – אברכי הכולל נכנסים מעת לעת לכיתות ומעבירים שיעורים לקראת החגים ובנושאים שונים.
